Tomando en cuenta los dos perfiles profesionales que orientan los enfoques de profundización y de investigación de la Maestría, los cursos del plan de estudios están organizados en un ciclo básico (primer ciclo) y en un ciclo específico (segundo ciclo) que son comunes en ambos enfoques y que determinan los respectivos cursos básicos y específicos, dado que la fundamentación disciplinar de las maestrías es común.

Perfil del Egresado:

Énfasis en profundización: El Profesional de la Maestría en Gerencia de Proyectos con énfasis en Profundización se formará con sólidos conocimientos y competencias para que a través de la formalización del conocimiento, la apropiación de metodologías y el análisis situacional, plantee soluciones novedosas a problemas concretos en el ámbito de la formulación, la evaluación y la dirección de proyectos. 

Énfasis en Investigación: El Profesional de la Maestría en Gerencia de Proyectos con énfasis en Investigación se formará con sólidos conocimientos y competencias en la aplicación de los métodos científicos, útiles para desarrollar procesos investigativos que generen nuevo conocimiento para la solución de problemas en el ámbito de la formulación, evaluación y dirección de proyectos.