El perfil del profesional de la Microbiología de la Universidad Santiago de Cali implica al menos el desarrollo de las siguientes competencias:

• Ser un profesional integro, equilibrado en su dimensiones personal, social, espiritual, y científica; comprometido con la sociedad y el medio ambiente.
• Capaz de tomar decisiones de forma autónoma y asumir los retos que le toque enfrentar en la industria y el medio ambiente.
• Aborde de manera interdisciplinaria problemas ambientales y sus efectos sobre los sistemas físicos, bióticos y humanos.
• Posea el conocimiento necesario que le permita diseñar e implementar medidas de prevención, mitigación y corrección de los impactos industriales y ambientales.
• Conocimientos y manejo de las técnicas básicas para que diseñe y ejecute experimentos, procese resultados y evalúe técnicas, procedimientos, muestras representativas, empleando criterios estadísticos.
• Habilidades y conocimientos para el uso de los sistemas y la informática para la planeación experimental.
• Capacidad para redactar informes científico-técnicos, valorando los resultados del trabajo y defendiendo los mismos ante la comunidad científica nacional e internacional.
• Capacidad de trabajo interdisciplinario tanto en ciencia básica como aplicada.
• Capacidad para adaptarse y apropiarse de los cambios científico-tecnológicos, y para promover su transferencia a contextos locales, así como para proponer nuevas alternativas de desarrollo.