El programa de maestría se encuentra dirigido a ingenieros civiles, ambientales, y químicos con deseos de profundización técnica, o con vocación de investigación y docencia. Sin embargo, se permite el ingreso de profesionales de otras ramas de la ingeniería y carreras afines, tales como la arquitectura y la ecología.

El Departamento ofrece dos modalidades diferentes en sus programas: la maestría profesional y la maestría de investigación.

La maestría profesional está diseñada para los ingenieros que, en desarrollo de su carrera, consideran apropiado volver a la Universidad para profundizar sus conocimientos focalizando su interés en unos pocos temas. Su interés primordial es actualizar y profundizar sus conceptos, y familiarizarse con las últimas prácticas tecnológicas, y su intención muy probablemente es continuar ejerciendo la práctica de su profesión.

La maestría de investigación está diseñada para los ingenieros con una vocación por los temas de investigación y la docencia universitaria. En algunos casos puede ser un primer paso antes de seguir un programa de formación doctoral y una carrera académica. El énfasis de este programa se centra en una tesis investigativa y en cursos que refuerzan el conocimiento y la habilidad requeridos para adelantar con éxito el trabajo de investigación, y en desarrollar la capacidad de comunicación y de trabajo interdisciplinario.